Gasbrønde bores ofte igennem eller i nærheden af akviferer, og klager over forurenet brøndvand er ikke ualmindelig. En ofte udtrykt frygt, især i områder, hvor fracking er ny, er, at bruddet af sten underjordisk tillader forurenede væsker og befriede skifergas at migrere opad fra skiferaflejringen og ind i vandtabellen. Industriens embedsmænd insisterer, og de fleste miljømæssige embedsmænd er enige om, at dette er yderst usandsynligt. Et typisk frackejob udføres på dybder på 1.500 til 2.500 meter (5, {{5} til 8, 000 fødder). Mellem skiferaflejringen og gulvet i en akvifer (som normalt findes mere end et par hundrede meter under overfladen) er adskillige lag af sten, der ville forhindre infiltration af gas og væske, selvom nogle forskere mener, at der er en chance, i nogle geologiske formationer, der frigjort skifergas kan være i stand til at følge eksisterende fejl og frakturer opad til vandbordet. Et mere sandsynligt scenario, der er foreslået af nogle forskere, kan være diffusionen af skifergas gennem gamle, desværre brønde, der ikke er blevet tilstrækkeligt indkapslet eller tilsluttet. En ofte dokumenteret årsag til lokal forurening er defekt foringsrør i den del af en aktiv gasbrønd, der passerer gennem en akvifer, hvilket gør det muligt for produktionsgas og væsker at passere i vandforsyningen.
I 2010 skabte Gasland, en amerikansk dokumentarfilm, der var kritisk over fra fracking, en sensation med sine optagelser af en køkkenhane, der spydede flammer i Fort Lupton, Colorado. Succesen med filmen (som blev nomineret til en Oscar -pris) inspirerede en række imiteringsvideoer på Internettet. Sådanne begivenheder kan faktisk kunne spores til boring, som ved mange lejligheder har forstyrret tidligere ukendte lommer med gas placeret tæt på akviferer, hvilket gør det muligt for metangas at gennemsyre brøndvand i koncentrationer højere end normalt. Imidlertid kan sådanne forstyrrelser skabes ved boring af næsten enhver art, hvad enten det er til gas, olie eller endda godt vand. Af denne grund insisterer industriens embedsmænd, mens de indrømmer, at boreprocedurer skal holdes til strenge standarder, ikke desto mindre insisterer på, at eksplosive forhold næsten helt sikkert ikke ville blive forårsaget direkte af den hydrauliske brud på skiferaflejringer dybt under jorden.
